
Publicado el 27 de marzo de 2018
Troutlodge mejora la resistencia a la enfermedad bacteriana del agua fría usando selección genómica
Troutlodge en cooperación con el USDA, muestra resultados fantásticos para la selección genómica durante los últimos estudios.
La selección genómica permite seleccionar truchas con una mortalidad un 94% menor en comparación con la población no seleccionada. En contraste, la selección convencional de familia BLUP sólo pudo seleccionar truchas con una mortalidad un 13% menor.
Desde 2015, Troutlodge ha estado aplicando la selección genómica en su programa de cría para mejorar la resistencia a la Enfermedad Bacteriana del Agua Fría (BCWD, por sus siglas en inglés) en truchas arco iris (síndrome de los alevines de trucha arco iris). El BCWD es un problema enorme para la industria mundial de la trucha, responsable de grandes pérdidas económicas causadas por una mortalidad de hasta el 85% en brotes severos. Troutlodge continuamente utiliza pruebas de enfermedades intensivas para detectar y mejorar el rendimiento de sus poblaciones de truchas.
El análisis de la población que fue sometida a un cribado de resistencia a la BCWD mostró que la metodología de selección genómica fue capaz de seleccionar truchas con una mortalidad un 94% menor en comparación con la población no seleccionada. En contraste, la selección convencional de la familia BLUP sólo pudo seleccionar truchas con una mortalidad un 13% menor.
La selección convencional de familia BLUP para los usos de resistencia a enfermedades significa el desempeño de la familia para clasificar a los individuos. Aquí, cada candidato a la cría de la misma familia obtiene el mismo valor medio de cría. Sin embargo, en realidad, incluso dentro de las familias hay animales genéticamente mejores y peores. La selección genómica incorpora información del perfil genómico (genes*) de cada animal. Esto nos permite capturar las diferencias genéticas dentro de las familias y es mucho más preciso para la selección.
Más allá de los QTL
El análisis de los datos de la secuencia genómica también reveló seis rasgos cuantitativos (QTL) juntos, explicando más del 60% de la variación genética en el estudio de desafío. La presencia de los seis QTL indica que hay algunos genes importantes que explican gran parte (60%) de la resistencia a esta enfermedad, pero que es muy probable que los genes más "pequeños" estén jugando un papel importante. Para explicar la parte restante de la variación genética (40%), no explicada por las QTL, y para calcular con mayor precisión los valores de reproducción "genómica", debe utilizarse la selección genómica. Estos resultados muestran la eficacia de la selección genómica.

Innovación
Troutlodge se beneficia de ser parte de Hendrix Genetics, un líder mundial en la cría de animales con un amplio portafolio multi-especies. A través de Hendrix Genetics, Troutlodge tiene más acceso al capital tanto monetario como científico; así como también gana la habilidad de acceder al conocimiento experto en técnicas como la selección genómica, la cual está bien estudiada en otras especies. Todos estos factores crean mejores productos para la cadena de producción global de truchas. Para obtener más información sobre cómo pedir cepas resistentes al BCWD, contáctenos.
Nota: con la selección genómica, usamos el hecho de que muchos genes en el ADN están codificando para un efecto en un rasgo. Mientras que esperamos que un pequeño número de genes tenga un efecto significativo y que el efecto de la mayoría de los genes sea cero, el gran poder de la Selección Genómica se deriva del gran número de genes cuyos efectos, aunque pequeños, no son cero. Son estos muchos miles de efectos diminutos que combinados suman un efecto muy significativo. Un valor genómico estimado de reproducción (GEBV) para un animal en particular en este contexto es la suma calculada de todos estos efectos. La incorporación de información sobre el perfil genómico nos permite predecir con mayor precisión el valor reproductor de un animal, más allá del mero uso de QTL.